Pedro Naves licenciou-se em Biologia, tendo defendido a Tese de Doutoramento em Entomologia Florestal na Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa. Desde 2020 é Responsável Técnico do Laboratório de Acarologia do Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária (INIAV). Como investigador científico, tem-se focado nas vertentes de sanidade e proteção de plantas, ecologia, biologia e gestão integrada de pragas agrícolas e florestais, incluindo insetos e ácaros de regulamentação de quarentena.

É responsável pela identificação taxonómica de pragas regulamentadas (insetos e ácaros) a partir de levantamentos fitossanitários feitos pela DGAV, com qualificações taxonómicas na identificação morfológica de adultos e estádios larvais de diferentes Ordens de insetos florestais.